Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp49Q6P9L4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms