Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smchd1Q6P5D8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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