Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms