Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms