Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnpo3Q6P2B1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms