Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd2Q6NXI6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms