Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms