Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms