Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms