Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms