Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf8Q6DID3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms