Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Cep290Q6A078 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Cep290Q6A078 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cep290Q6A078 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cep290Q6A078 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cep290Q6A078 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cep290Q6A078 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cep290Q6A078 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Cep290Q6A078 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cep290Q6A078 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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