Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sv2cQ69ZS6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms