Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdk13Q69ZA1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms