Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Sbno1Q689Z5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Sbno1Q689Z5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Sbno1Q689Z5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno1Q689Z5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms