Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms