Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms