Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms