Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms