Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Irf4Q64287 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Irf4Q64287 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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