Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms