Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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