Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hoxa13Q62424 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hoxa13Q62424 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hoxa13Q62424 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hoxa13Q62424 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hoxa13Q62424 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hoxa13Q62424 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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