Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl12Q62401 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms