Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt6hQ62383 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt6hQ62383 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt6hQ62383 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt6hQ62383 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt6hQ62383 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt6hQ62383 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt6hQ62383 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt6hQ62383 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt6hQ62383 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt6hQ62383 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms