Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SypQ62277 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SypQ62277 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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SypQ62277 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SypQ62277 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SypQ62277 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SypQ62277 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SypQ62277 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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