Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms