Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Kdm5dQ62240 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms