Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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