Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms