Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms