Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms