Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms