Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc2Q62029 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms