Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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