Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms