Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms