Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nell2Q61220 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms