Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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