Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms