Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms