Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik1Q60934 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms