Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a4Q60857 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms