Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tnfrsf8Q60846 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tnfrsf8Q60846 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tnfrsf8Q60846 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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