Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Klf4Q60793 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Klf4Q60793 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Klf4Q60793 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Klf4Q60793 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Klf4Q60793 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Klf4Q60793 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Klf4Q60793 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Klf4Q60793 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms