Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cdkn2cQ60772 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2cQ60772 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms