Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms