Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms