Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms