Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SkiQ60698 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SkiQ60698 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms